此次選出的新任主席任期雖僅到明年8月，卻承擔帶領國民黨改革再起的重責大任。臺南昆山科技大學國際學院院長丁仁方接受記者采訪時指出，1年多的任期里，洪秀柱至少面臨五大挑戰，尤以改革為要務，雖是“過渡型領導人”，但也著實不輕松。

　　首先，國民黨要打一場“黨產守護戰”。占“立法院”多數的民進黨打著“轉型正義”的旗號，正對國民黨進行政治清算。國民黨黨產問題盤根錯節，正面處理黨產將是新主席的必考題，但黨產不可能全部清理，放掉多少直接涉及到未來重建的資本。

　　其次，國民黨面臨最大的一個問題是人才斷層的問題。從“九合一”大選到“立委”選舉，直至在“中央”失去政權，越發凸顯其無人可用之窘境。培養人才迫在眉睫，畢竟2018年地方選舉、2020年“立委”選舉，也是說到就到，現在就要開始找人。但問題是人在哪里？這也是國民黨一直為人詬病的。

　　再次，洪秀柱說自己“只當一任主席”，所以接下來為自己找好主席接班人也是一大挑戰。此次主席補選，黨內大咖如王金平、吳敦義、郝龍斌等都沒有參加，明年任期結束，誰來接任黨主席？是朱立倫回鍋？為了全面改革，首先要培養人才，現在的“行政院長”張善政等有行政歷練的人才，或許更有魄力。

　　又次，5·20之后，國民黨成為反對黨，從“立委”席次到縣市長位次，都是少數。作為黨主席，洪秀柱面臨把這些“少數力量”團結起來，從而打造“國民黨品牌”的挑戰。是否能像民進黨喊出的“綠色執政 品質保證”一樣，在做好監督黨角色的同時，在地方也能有“藍色執政 品質保證”的表現，拭目以待。

　　最后，黨內路線的修正與調整也考驗著洪秀柱的政治智慧。洪秀柱的背景及兩岸論述讓黨內本土派“不放心”，更有批其“新黨化”的疑慮。對洪秀柱來說，是否能夠帶領日后的國民黨進行轉型，同時在中南部的基層獲得支持仍是問號。