據臺灣《中國時報》報道，臺灣農業部門負責人陳保基指出，早在2006年10月，也就是民進黨“執政”時代，就突然根據兩份剪報將萊克多巴胺公告為毒害藥品，當時臺灣本地與進口畜產品均不得檢出萊克多巴胺的殘留。
陳保基說，根據當時留存的資料，2007年8月臺“衛生署”與“農委會”同步分別預告訂定“萊克多巴胺”殘留容許量及解除禁用“萊克多巴胺”，并通知WTO。但因預告發布后，有消費者及養豬產業團體強烈抗議，而未完成解禁公告。
美國牛肉問題引起各界關注，國民黨中常會邀請“農委會主委”陳保基進行專題報告。身兼國民黨主席的馬英九聽取報告后重申，當局沒有預設立場、沒有時間表、也沒有對美方做任何承諾，他并強調消費者健康是當局的第一考慮。
臺灣“在野”黨抨擊馬當局已決定開放瘦肉精，以回報選前美方支持國民黨候選人。馬英九昨天(2月29日)高喊，“天大的誤解！”由于民間團體要求跨部門美國牛肉技術咨詢小組公開信息，不要“黑箱作業”，馬英九也宣布，第三次會議將全程開放。
