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吳敦義表示，臺商過去面臨兩項障礙，一個是租稅優惠，原本的營所稅，在“產創條例”從25%降為17%后，獲得解決；另一項是外勞工資的問題。
吳敦義說，因為自由貿易港區外勞有一定比例，是否與基本工資17280元(新臺幣，下同)脫鉤，這中間的連動性該如何做，有空間可以考慮。外勞雖依據17280元基本工資，但實際上只有領到8,000元、9,000元，中間除了2,000元是就業安定費外，其余額度都是在中介手續費、成本、服務費等。
吳敦義指出，若此問題能獲得技術上解決，臺商就會備受鼓舞，將有利于島內投資，吸引臺商鮭魚返鄉，而且不是只有鮭魚，說不定大一點的鯨魚也都會回來，但現在仍有一些問題要克服。
此外，財經部門高層認為，“自貿港區條例規定”，外勞比例雖可提升至40%，但因服務業不能使用外勞，還是會阻礙物流運輸業進駐意愿，未來不排除討論跨行業整合方式確定外勞總額比例，為運輸物流等行業解套。
據悉，為因應兩岸6月洽簽ECFA后經貿新局勢，“經建會”正討論設立“經貿營運特區”，進行兩岸產業結構分工，同時讓跨國企業利用臺灣地區作為進軍大陸市場平臺，擬構想選定自貿港區“四海一空”規劃為特區，或利用加工出口區規劃為特區。措施包括外勞彈性引進比例，與基本工資脫勾、租稅誘因等。
